鯨準(zhǔn)基因組學(xué)單分子分析與分選儀- |
鯨準(zhǔn)基因組學(xué)單分子分析與分選儀-
及配套的試劑盒 1. 功能、機(jī)制、性能、分類定位 丹麥公司的 (&Sorter)多功能雙乳化液滴包裹與分選系統(tǒng)是一個(gè)經(jīng)濟(jì)高效的核酸單分子分析解決方案。支持核酸分子封裝在高度穩(wěn)定的雙乳化液滴中，充當(dāng)皮升級(jí)的微反應(yīng)空間環(huán)境，可用于核酸分子在位PCR擴(kuò)增、富集、結(jié)構(gòu)與組成分析等操作。通過(guò)將體量形式的核酸樣品分析轉(zhuǎn)變?yōu)橐旱蝺?nèi)單個(gè)分子樣品形式的高分辨率和高靈敏分析，提高核酸分析的速度和準(zhǔn)確性，從而變革您分析核酸的傳統(tǒng)方式。 在液滴包裹核酸分子的高通量生成方面， 結(jié)合雙乳化DE20試劑盒在短短40分鐘內(nèi)，每個(gè)通道生成高達(dá)800萬(wàn)個(gè)DE20液滴，共有8個(gè)通道。液滴可穩(wěn)定存儲(chǔ)達(dá)數(shù)月之久。 ?是一種基于微流體液滴包裹封裝核酸分子的新型DNA富集技術(shù)，能夠富集長(zhǎng)達(dá)(~100 kb) 的感興趣區(qū)域。該技術(shù)要求在感興趣區(qū)域(ROI) 內(nèi)或側(cè)翼區(qū)域內(nèi)設(shè)計(jì)單個(gè)擴(kuò)增檢測(cè)序列的引物對(duì)。該擴(kuò)增子專門(mén)用于ROI的檢測(cè)、選擇和富集。 手先，將drop待分析DNA樣品分割成為數(shù)百萬(wàn)個(gè)雙乳化液滴，從而使單個(gè)或數(shù)個(gè)DNA分子封裝包裹在這樣的液滴當(dāng)中。通過(guò)對(duì)感興趣區(qū)域或其兩側(cè)翼內(nèi)與檢測(cè)序列特異對(duì)應(yīng)的長(zhǎng)度為120-160bp序列進(jìn)行液滴PCR擴(kuò)增，實(shí)現(xiàn)對(duì)含有目標(biāo)DNA分子的液滴的識(shí)別。 核酸序列定向富集功能的典型應(yīng)用方向有但還限于： 序列的結(jié)構(gòu)變化分析；序列的串級(jí)重復(fù)分析；序列中GC富集區(qū)域分析；序 列缺失的回補(bǔ)分析；CRISPER基因編輯驗(yàn)證分析；轉(zhuǎn)基因或病毒DNA的嵌入分析。 ?系統(tǒng)結(jié)合了高分辨率液滴PCR(dPCR)與液滴分選和液滴多重取代擴(kuò)增(dMDA)兩項(xiàng)新技術(shù)。 的核心創(chuàng)新點(diǎn)就是超穩(wěn)定雙乳化液滴包裹技術(shù)，它的快速、靈敏分析you勢(shì)源于液滴微空間內(nèi)加速的反應(yīng)動(dòng)力學(xué)過(guò)程。 液滴包裹中使用的表面活性劑是公司專有的配方，不含有動(dòng)源成分，能保障哺乳動(dòng)物細(xì)胞的長(zhǎng)時(shí)間高存活率。 是目前wei依能提供完Quan一體化雙乳化液滴試劑盒的廠家。 產(chǎn)品用途定位：核酸單分子化處理（單、雙乳化液滴包裹）和單核酸分子分析系統(tǒng)，對(duì)標(biāo)類似進(jìn)口產(chǎn)品有：伯樂(lè)的QX200。 2. 應(yīng)用方向例： 1) 用驗(yàn)證CRISP編輯 使用?驗(yàn)證CRISPR編輯可檢測(cè)意外脫靶重排。 采用傳統(tǒng)的PCR方法對(duì)CRISPR-Cas9編輯進(jìn)行篩查可能會(huì)錯(cuò)過(guò)發(fā)現(xiàn)較大的缺失和復(fù)雜的重排。在這里，展示了間接序列捕獲技術(shù)是如何幫助識(shí)別和闡明意外插入序列和未被檢測(cè)到的插入序列的。 目前的CRISPR-Cas9編輯的檢查點(diǎn)集中在預(yù)期修改區(qū)域的附近處相對(duì)較小的非有意編輯。然而，大的刪除和復(fù)雜的重排可能會(huì)發(fā)生。傳統(tǒng)的PCR篩查策略很容易忽略這些變化，特別是當(dāng)它們只影響其中一個(gè)等位基因時(shí)。 支持CRISPR編輯驗(yàn)證。它能夠確認(rèn)生物信息學(xué)上預(yù)測(cè)的復(fù)雜脫靶編輯和圍繞CRISPR切割位點(diǎn)的意外重排(包括缺失改變)。該工作流程只需要非常少量的輸入DNA和設(shè)計(jì)一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的引物對(duì)。引物結(jié)合位可以設(shè)計(jì)在遠(yuǎn)離基因編輯位點(diǎn)千堿基的地方，從而避免即使是千堿基長(zhǎng)的重排。 使用的間接序列捕獲法有助于識(shí)別和闡明只發(fā)生在一個(gè)等位基因上一個(gè)wu意的插入序列，而這在以往的方法中是檢測(cè)不到的。 2) 病毒整合檢測(cè) 用?解析復(fù)雜的結(jié)構(gòu)變化: 檢測(cè)人類基因組中HPV18病毒整合位點(diǎn)。 我們?cè)u(píng)估?技術(shù)在人類癌癥細(xì)胞系HeLa上的應(yīng)用，設(shè)計(jì)了一個(gè)針對(duì)人類乳頭瘤病毒18(HPV18)基因組整合的富集實(shí)驗(yàn)。?成功富集和鑒定了HVP18病毒在人類基因組中的整合位點(diǎn)。 3) 區(qū)分真假基因 用對(duì)CRP2D6進(jìn)行定相：區(qū)分真假基因。 CYP2D6編碼細(xì)胞色素P450，這是一種負(fù)責(zé)代謝或激活近25%現(xiàn)有藥物的酶。它的高多態(tài)性導(dǎo)致個(gè)體之間酶活性的相當(dāng)大的變化，這影響了他們對(duì)不同藥物的反應(yīng)，包括抗精神病藥、β -受體阻滯劑、抗抑郁藥、抗高血壓藥、抗糖尿病藥等等。基于短讀測(cè)序，對(duì)這個(gè)相當(dāng)小的基因(4.4 kb)進(jìn)行基因分型具有挑戰(zhàn)性。該基因表現(xiàn)出結(jié)構(gòu)變異，如復(fù)制和缺失，以及雜交基因轉(zhuǎn)換。其兩側(cè)還有2個(gè)基因/偽基因CYP2D7和CYP2D8，序列同源性超過(guò)90%。然而，?富集后的長(zhǎng)讀測(cè)序解決了這個(gè)問(wèn)題。 4) 尋找轉(zhuǎn)基因插入位點(diǎn) 用驗(yàn)證基因組編輯:間接序列捕獲法檢測(cè)小鼠系的一個(gè)轉(zhuǎn)基因。 幾十年來(lái)，接合子轉(zhuǎn)化過(guò)程一直被用于構(gòu)建表達(dá)外源基因的轉(zhuǎn)基因動(dòng)物模型。自1981年，當(dāng)?shù)芤粋€(gè)轉(zhuǎn)基因小鼠通過(guò)將DNA微注射到單細(xì)胞胚胎中產(chǎn)生以來(lái)，在表達(dá)報(bào)告系統(tǒng)或涉及疾病的關(guān)鍵基因的小鼠系中已經(jīng)創(chuàng)造了近6500個(gè)轉(zhuǎn)基因等位基因。眾所周知，注入的轉(zhuǎn)基因會(huì)隨機(jī)插入受精卵基因組中，而且許多系的確切插入位置和模式都是未知的。傳統(tǒng)的鑒定插入位點(diǎn)的方法，如DNA FISH或配對(duì)測(cè)序，成本昂貴，或者wu法揭示關(guān)鍵的缺失和重排。?富集的長(zhǎng)DNA片段解決了這些問(wèn)題，使插入位點(diǎn)檢測(cè)成為一個(gè)簡(jiǎn)單的過(guò)程。 3. 產(chǎn)品規(guī)格 Desktop, Width: 25 cm，Height: 25 cm，Length: 48 cm，Weight 17 kg， Voltage requirements: 110 V – 240 V |
